Общее руководство Администрацией осуществляет Губернатор Калужской области.

Текущее руководство Администрацией осуществляет заместитель Губернатора - руководитель администрации Губернатора Калужской области, назначаемый на должность и освобождаемый от должности Губернатором.

Руководство:

Структура:

Правовое управление 

Отдел правового обеспечения деятельности Губернатора и Правительства Калужской области

Отдел регистрации нормативных правовых актов

Отдел законодательных инициатив

Отдел экспертизы муниципальных нормативных правовых актов

Управление кадровой политики и взаимодействия с территориями 

Отдел государственной службы и кадров

Отдел наград

Отдел по взаимодействию с территориями

Отдел по формированию резерва управленческих кадров

Контрольное управление 

Отдел контроля

Отдел контроля за оперативными поручениями и аналитики

Управление по работе с обращениями граждан, их объединений и делопроизводству

Отдел по работе с обращениями граждан

Отдел электронного документооборота

Протокольный отдел

Управление по защите государственной тайны и мобилизационной подготовке 

Отдел мобилизационной подготовки

Режимно-секретный отдел

Административно-хозяйственное управление

Управление бухгалтерского учёта

Управление по протокольному и информационно-аналитическому обеспечению деятельности Губернатора Калужской области (Аппарат Губернатора Калужской области)

Отдел специальной документальной связи

Отдел организации деятельности Правительства Калужской области

Отдел по профилактике коррупционных правонарушений

Отдел по организации территориальной обороны и взаимодействия с органами военного управления

Отдел по обеспечению деятельности антитеррористической комиссии

Отдел по обеспечению деятельности комиссии по делам несовершеннолетних и защите их прав Калужской области